深圳市太空科技南方研究院基于深圳市人民政府與中國航天員科研訓(xùn)練中心簽訂的《戰(zhàn)略合作框架協(xié)議》而設(shè)立。其宗旨是依靠政府的支持、資助，搭建國家級的創(chuàng)新平臺；拓展國際合作，整合創(chuàng)新資源；依托機(jī)制創(chuàng)新，推進(jìn)載人航天技術(shù)成果產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。

研究院的舉辦者為太空科技南方中心和深圳太空科技有限公司，定位為主要利用非國有資產(chǎn)、舉辦者自愿舉辦、從事非營利性社會服務(wù)活動的社會組織。主要開展載人航天相關(guān)技術(shù)的研究開發(fā)、成果轉(zhuǎn)化、科普教育和國際合作等業(yè)務(wù)，側(cè)重于應(yīng)用研究和民用轉(zhuǎn)化研究，航天員中心作為我國載人航天工程重要科研機(jī)構(gòu)，通過40多年的科研創(chuàng)新和技術(shù)積累，在相關(guān)領(lǐng)域特別是生命保障與健康醫(yī)學(xué)等方面具有極好的應(yīng)用轉(zhuǎn)化空間。研究院將成為航天員中心除北京本部之外開展應(yīng)用技術(shù)科研、科技成果轉(zhuǎn)化、科普教育及國際合作的唯一綜合性平臺。